ЭФФЕКТИВНОСТЬ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ПЦР-ПДРФ АНАЛИЗА И РЕАЛ-ТАЙМ ПЦР ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ НОСИТЕЛЕЙ СИНДРОМОВ DEVELOPMENTAL DUPLICATIONS, ARTHROGRIPOSIS MULTIPLEX У КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
DOI:
https://doi.org/10.52269/RWEP252128Ключевые слова:
гены NHLRC2, ISG15, HES4, AGRN, делеция, , наследственные аномалии Developmental Duplications, Arthrogriposis multiplex,, ПЦР-ПДРФ, Реал-Тайм ПЦР, генетический скринингАннотация
Авторами статьи проведена оптимизация молекулярно-генетических способов детекции носителей синдромов Developmental Duplications, Arthrogriposis multiplex, определена распространенность указанных аномалии у ангусской, герефордской, казахской белоголовой, аулиекольской, калмыцкой пород (n=37). На основании детального анализа последователностей генов NHLRC2, для диагностики носителей Developmental Duplications был использован метод ПЦР-ПДРФ анализа, идентификация точечной мутации g.34618072 T>C в 5 экзонной части гена NHLRC2 была осуществлена с помощью эндонуклеазы Mwol. С целью совершенствования способа диагностики генетической аномалии Developmental Duplications был разработан метод Реал Тайм ПЦР диагностики, который позволяет в течение 2 часов определить гетерозиготных носителей мутации g.34618072 T>C в 5 экзонной части гена NHLRC2. Известно, что синдром Arthrogriposis multiplex появился вследствие обширной делеции, которая охватила кодирующие участки трех генов – ISG15, HES4, AGRN – длиной 38 000 п.н. Были подобраны последовательности одного общего прямого праймера и двух обратных праймеров, идентифицирующих мутантные и дикие типы аллелей генов ISG15, HES4, AGRN. По результатам генотипирования частота всречаемости генетической аномалии Developmental duplication у ангусской породы составила 12,5%, синдрома Arthrogriposis multiplex у герефордской породы – 11,1%.