ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ НАСЛЕДСТВЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ У ЛОШАДЕЙ КОСТАНАЙСКОЙ И АДАЙСКОЙ ПОРОДЫ: ЧАСТОТА НОСИТЕЛЬСТВА МУТАЦИЙ SCN4A, GYS1, GBE1, PPIB, EDNRB и STX17

Генетические варианты

Аннотация

Генетически обусловленные заболевания у лошадей влияют на здоровье животных, эффективность племенной работы и спортивное использование. В данном исследовании проведён генетический мониторинг шести мутаций, связанных с заболеваниями: HYPP (SCN4A), PSSM1 (GYS1), GBED (GBE1), HERDA (PPIB), LWFS (EDNRB) и Grey/меланомой (STX17), в популяциях казахстанских лошадей — Костанайской породы и Адайского типа. Анализ включал три набора данных: генотипы 1630 лошадей и полногеномное секвенирование 65 лошадей отобранных в рамках проекта Программы BR10764999 «Разработка технологий эффективного управления селекционным процессом и сохранения генофонда в коневодстве»; данные 96 лошадей отобранных в рамках проекта Программы BR22885681 «Совершенствование существующих методов управления генетическими ресурсами адайских и костанайских лошадей с сохранением генофонда костанайской породы». В первых двух наборах рассматривалось 68 974 SNP, включая позиции в SCN4A и PPIB. Все животные оказались гомозиготами по референтным аллелям. В третьем наборе проверены все шесть генов по координатам в геноме EquCab3.0; ни в одном случае отклонений от референса не выявлено. Таким образом, у казахстанских лошадей не обнаружено ни одной из исследованных мутаций. Возможные причины заключаются в следующем: во-первых, данные варианты характерны для зарубежных пород (American Quarter Horse, American Paint Horse, тяжеловозы, липиццианы), которые, вероятно, не завозились в Казахстан; во-вторых, традиционная система свободного выпаса способствует естественному отбору, снижая вероятность закрепления патологических аллелей. Полученные результаты свидетельствуют о генетической чистоте Костанайской породы и Адайского типа по данным мутациям и подчёркивают значение традиционных методов коневодства в поддержании устойчивости популяций.